Os recursos financeiros e as despesas da OMS na Região Africana são orientadas pela agenda mundial da OMS para a saúde, definida no 11.º Programa Geral de Trabalho para 2006-2015, e pelas orientações estratégicas para as Actividades da OMS na Região Africana no período de 2005-2009.
O Plano Estratégico de Médio Prazo da OMS define a orientação estratégica da Organização para o período de 2008-2013. Visa atingir 13 objectivos estratégicos:
- reduzir o fardo sanitário, social e económico das doenças transmissíveis;
- combater o VIH/SIDA, tuberculose e paludismo;
- prevenir e reduzir a doença, incapacidade e morte prematura por doenças crónicas não transmissíveis, perturbações mentais, violência e traumatismos
- reduzir a morbilidade e mortalidade e melhorar a saúde nas fases fulcrais da vida, incluindo a gravidez, nascimento, período neonatal, infância e adolescência, melhorar a saúde sexual e reprodutiva e promover o envelhecimento activo e saudável de todos os indivíduos;
- reduzir as consequências para a saúde de situações de emergência, catástrofes, crises e conflitos e minimizar o seu impacto social e económico;
- promover a saúde e o desenvolvimento e prevenir ou reduzir os factores de risco dos problemas de saúde associados ao uso do tabaco, álcool, drogas e outras substâncias psicoactivas, dietas não saudáveis, inactividade física e sexo sem segurança;
- enfrentar os determinantes sociais e económicos subjacentes à saúde, por meio de políticas e programas que privilegiem a equidade na saúde e integrem abordagens favoráveis aos pobres, sensíveis aos géneros e com base nos direitos humanos;
- promover um meio ambiente mais saudável, intensificar a prevenção primária e influenciar as políticas nacionais de todos os sectores, para que combatam as causas profundas das ameaças ambientais à saúde;
- melhorar a nutrição, a segurança e a suficiência dos alimentos ao longo da vida, em apoio à saúde pública e a um desenvolvimento sustentável;
- melhorar os serviços de saúde graças a progressos na governação, financiamento, gestão e recursos humanos, com base em dados factuais e investigação fiáveis e acessíveis;
- garantir melhorias no acesso, qualidade e uso de produtos e tecnologias médicas;
- providenciar liderança, reforçar a governação, celebrar parcerias e colaborar com os países, o sistema das Nações Unidas e outros intervenientes, para cumprir o mandato da OMS no sentido de fazer avançar a agenda da saúde no mundo, como consignado no 11.º Programa Geral de Trabalho; e
- desenvolver e manter a OMS como uma organização flexível e virada para o conhecimento, capacitando-a para cumprir o seu mandato de modo mais eficiente e eficaz.